Dzięki rewolucyjnej technologii, która odblokowuje pamięć zapisaną w genach Callum Lynch odkrywa, że jest potomkiem członka tajemniczego stowarzyszenia zabójców. Pozwala mu to przeżywać przygody swojego przodka, Aguilara, żyjącego w piętnastowiecznej Hiszpanii. Po odblokowaniu uśpionych umiejętności oraz wiedzy zaczyna podejmować walkę z groźnymi i potężnymi templariuszami.